它是一种两性离子缓冲液，它与许多常见金属形成强络合物；因此，稳定常数选择此缓冲液时应考虑浓度。它可用于蛋白质结晶的解决方案和作为移动阳离子交换色谱中的相缓冲液和洗脱液。
用于含金属离子的溶液中，因为它不会与大多数金属形成络合物。MES通常用于酵母，细菌和哺乳动物细胞的缓冲培养基中，但浓度高于10 mM时对植物有毒。MES在各种色谱和电泳实验中也是很好的缓冲液选择，因为它显示出较低的离子迁移率和电导率。在pH值为5.5至6.7的范围内，它是一种有效的缓冲剂。
常用于细菌、酵母和哺乳动物细胞的培养基。它通常用于细胞培养基，作为电泳中的运行缓冲液和蛋白质纯化。MOPS被认为是用于在琼脂糖中分离RNA的极佳缓冲液凝胶，由于发生的高分辨率分离和缺乏相互作用MOPS和RNase抑制剂DEPC之间的差异。它也被视为用途SDS-PAGE中的运行缓冲液。
它缺乏与大多数金属离子形成络合物的能力，一般用作金属离子溶液中的非配位缓冲液。它用作毛细管电泳中的载体电解质，以及谷胱甘肽合成酶的结晶缓冲剂；在荧光光谱法，分光光度法和等温滴定量热法中使用；与牛血清白蛋白（BSA）的肽骨架相互作用，防止BSA热变性；用作缓冲炭酵母提取物培养基的组成成分；用作测定生物治理海洋原油副产物的缓冲体系。
它实际上不溶于水，但如果游离酸增加PIPES的溶解度用NaOH将其转化为钠盐。缺乏与大多数金属离子形成重要络合物的能力，一般用作金属离子溶液中的非配位缓冲液。该缓冲区能够形成自由基，因此不适用于氧化还原反应。虽然PIPES可用作阳离子交换色谱中的缓冲液，但它应该由于相对较大的离子强度和浓度对pKa的依赖性。PIPES被认为是一种极好的固定缓冲液用于电子显微镜的植物细胞。
它能较长时间控制恒定的pH范围，低浓度的HEPES对细胞无毒性作用，常用于细胞培养，比如各种细菌、真菌的培养液或病毒保存液中可以通过添加HEPES来维持细胞、细菌、病毒所需的pH环境。另外，它能干扰DNA和限制性内切酶之间的反应，但程度低于类似的具有较少取代胺基的缓冲液，这种缺乏干扰的发生主要是因为质子化叔胺的空间位阻在HEPES中允许与DNA的负电荷比大多数更弱。
HEPPSO
HEPPSO已被用作糖原合成酶的结晶缓冲液酶和与HEPPSO复合的酶。HEPPSO对指示物种Daphniamagna几乎没有毒性，因此被认为适合毒理学研究。该缓冲区能够形成自由基，因此不适用于氧化还原反应。HEPPSO形成一个与Cu2+离子络合；因此，稳定性常数和浓度应为在含有铜离子的溶液中使用该缓冲液时要考虑到这一点。虽然HEPPSO与铜离子结合，但它仍然是适用于二辛可宁酸。
作为DNA筛分体系中常用的缓冲液体系，也可作为RNA样品的缓冲液成分；适用于叶绿体薄层备样的电子传递和磷酸化研究；可作为毛细管区带电泳进行蛋白微量分析的背景电解质；能维持反应体系的pH值。常用于一些生化诊断试剂盒、PCR诊断试剂盒以及DNA/RNA提取等试剂盒当中。
