肝素在临床血液检验中以钠盐和锂盐为常见，具有独特的应用价值，肝素螯合力低，对水分子运动的影响小，对血液成分干扰少，不影响红细胞体积，不引起溶血，所以在多种以全血或血浆为标本的检验中，推荐使用肝素作为抗凝剂。
肝素锂和肝素钠在临床上都具有抗凝血的作用，主要用于血栓栓塞性疾病、心肌梗死、心血管手术、心脏导管检查、体外循环、血液透析等，因为所结合的离子不同，所以它的解离程度等是不一样的，其中的效果相比肝素钠的效果更好。
在对ph值、血气、电解质和钙离子的检测中，肝素是唯一可以使用的抗凝剂，而肝素锂在检测非锂离子时产生干扰的可能性最小，所以推荐使用肝素锂作为抗凝剂，目前在血液检验中，肝素锂正在逐步取代肝素钠。
用于血液透析后病人生化检验
血液透析后病人的血液样本是很多医院检验科所要面临的一种特殊样本，许多检验人员面对此类样本时常常感到束手无策。这是因为透析病人在血液透析过程中，使用了含有肝素的抗凝药物如低分子肝素钙等，此时由于血液中含有一定量的肝素抗凝药物，血液抽取后置于普通管或分离胶/促凝剂管中均极不容易凝固，不易分离出血清。
有报道称用肝素锂抗凝血浆与血清检测血K，其检测结果分析有偏倚，可能为血样在离心过程中转速过高，纤维蛋白丝网罗的血块中的红细胞受挤压破坏溶血，红细胞内的K离子释放至血清所致。另血液样本在转运和凝固过程中难免有少量的红细胞破坏，造成血K的轻度偏高。
另有报导用肝素锂抗凝血浆与血清检测CK-MB、LDH、GLU等结果有显著差异，可能系标本有溶血或放置时间过长血糖分解之故。相反肝素抗凝剂有不影响细胞体积，不易造成溶血的优点，不需要水浴放置，可直接离心。肝素锂抗凝血浆测得的血K、GLU、LDH等，准确地说更接近病人体内的真实浓度。因此尽快建立血浆生化检验参考值体系，有助于临床医生对患者病情作出准确判断。
用于常规生化检验
研究结果表明，大部分常规生化检验项目可用肝素锂抗凝血浆代替血清，但Glu、K+、Na+、CI-、P3-应建立血浆参考范围，其余项目可用血清参考范围解释血浆检测结果；Lp(a)、PA、HBDH、LDH、CK、CKMB、IgM等项目不宜用肝素锂抗凝血浆样本进行测定，血浆Lp(a)随着肝素浓度增大而增大。
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